বাস্তব, যুগোপযোগী ও গুণগত মানসম্পন্ন শিক্ষা প্রদানই এ প্রতিষ্ঠানের প্রধান লক্ষ্য। বাংলাদেশে চাহিদার তুলনায় মানসম্মত স্কুল ও কলেজের সংখ্যা খুবই কম। সংখ্যাগরিষ্ঠ স্কুল ও কলেজগুলোতে অনুমোদিত পাঠ্যক্রম ও পাঠ্যসূচির আলোকে গতানুগতিক ধারায় শুধু শ্রেণিকক্ষে পাঠদান করা হয়ে থাকে। শিক্ষার্থীদের জীবনের সকল স্তরে তথা কর্মময় বাস্তব জীবনে চলার পথে পাথেয় হিসেবে শিক্ষার্থীদের মধ্যে নৈতিকতা ও শৃঙ্খলাবোধ, ধর্মীয় ও মানবিক মূল্যবোধ ইত্যাদি গুণাবলী উজ্জীবনের কোন ব্যবস্থা বা প্রয়াস অনেক শিক্ষা প্রতিষ্ঠানে দৃশ্যমান নয়।

ফলশ্রুতিতে মূল্যবোধের অবক্ষয়, খুন-রাহাজানী, ছিনতাই, সন্ত্রাস ইত্যাদি অবাঞ্চিত ও সামাজিক অস্থিরতার মাত্রা দিন দিন অপ্রতিরোধ্য গতিতে বেড়েই চলেছে। এ অবস্থার নিরসনকল্পে কয়ারিয়া ঈদগাহ মাধ্যমিক বিদ্যালয় পাঠ্যসূচির সহগামী ও সম্পূরক কার্যক্রমের আওতায় ক্ষয়িষ্ণু মূল্যবোধসমূহ জাগ্রত করার ব্যবস্থা রয়েছে।